解释这个歇后语的痛苦原因很简单。打针是因为注射药物而引起的疼痛感，而吃黄连则是因为黄连具有苦味。所以说打针吃黄连是痛苦的，是因为这两种行为都会带来不愉快的感受。打针时针头刺入皮肤，刺激神经末梢引起疼痛感，这是人们常见的经历，所以会感到痛苦。而黄连的苦味则是因为其中的苦参碱和黄连素等物质的存在，这些物质会刺激舌头上的味蕾，使人感到苦涩。无论是打针还是吃黄连，都会带来不舒服的感觉，因此被形容为痛苦。
